من أبرز الأسباب التي استندت إليها مذكرات الطعن: القصور في الأسباب التي تؤيد الإعدام، والفساد في الاستدلال على تورُّط المتهمين في قتل مساعد مدير أمن الجيزة، والإخلال بحق الدفاع من قِبل هيئة المحكمة، والخطأ في تطبيق القانون، واعتماد حكم الجنايات على رواية قطاع الأمن الوطني التي قدّمها في محضر 22 متهماً بقتل اللواء نبيل فراج، مساعد مدير أمن الجيزة، على الأحكام الصادرة ضدّهم بمعاقبة 12 منهم بالإعدام شنقاً، والسجن المؤبد لـ 10 آخرين للنيابة العامة.