ومن المخالفات التي اكتشفت واستدعت تطبيق النظام حيال مرتكبها من المأذونين؛ إجراء عقد نكاح بولاية الأخ الشقيق مع وجود الأب، عدم تدوين تاريخ ومصدر شهادة الفحص الطبي، إجراء عقد النكاح قبل صدور شهادة الفحص الطبي، عدم تدوين ما يفيد الثبوتية للزوجة، اشتراط مبلغ مالي لمأذون الأنكحة، إجراء عقد النكاح بعد مضي أكثر من ستة أشهر على تاريخ الفحص الطبي وكثرة الشطب والتعديل وعدم الإشارة إلى صك حصر الورثة.