حصل ظافر بن علي القرني، على درجة الدكتوراه بتقدير ممتاز مع مرتبة الشرف الأولى، من كلية التربية في جامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية في الإدارة والتخطيط التربوي.